1 本课题的背景及意义
1.1背景
几何形态测量法起源于 20 世纪 80 年代末 90 年代初,它不同于传统的径向测量法,重点关注物体的外形变化,并通过相应的理论和方法,将不同物体鉴别出来,该方法对分析具有固定形态或组织的水生动物具有重要的意义,并已广泛使用于种类鉴别和种群划分等领域中。水生动物通常具有硬组织,这些硬组织具有较为固定的外形,因此本文对近十年来国内外学者利用几何形态测量法对水生动物形态以及硬组织的研究进行回顾,简述了该方法的发展历程,说明了外形轮廓法和地标点法的原理,同时介绍了常用的应用软件。根据应用种类的不同,对无脊椎动物和脊椎动物的几何形态测量分析进行了综述。分析认为,目前几何形态测量法已经逐渐开始得到各国学者的认同,但仅限于种类鉴别和种群划分中,今后的研究中应该更多利用耳石等硬组织进行几何形态的分析,并且结合环境的变化分析对几何形态所产生的影响; 同时,应加强该方法的理论研究,尝试用 3D 打印等方式更好地描述水生动物的几何形态差异
二、国内外相关研究综述
唐鱼(Tanichthys albonubes)隶属于鲤形目(Cypriniformes)、鲤科(Cyprinidae)、襁亚科(Danioninae),俗称白云山鱼,白云金丝等,是典型的亚热带小型溪流鱼类,由中国学者林书颜[1]于1932年依据广州白云山的标本定名。1935年,唐鱼作为观赏鱼被带入美国[2],由于其个体娇小活泼,色彩靓丽,易饲养,很快就在观赏鱼市场上流行开来,并传播至世界各地。野生唐鱼通常生活在水质清澈、无污染的山涧溪流上游区域,对生活环境要求很高,因此它也是一种理想的水质监测指标生物[3]。然而,其分布范围狭窄且呈点状分布,种群规模极小,加之多年来人类活动对其栖息地的破坏,使得野生种群数量锐减,甚至一度被认为野外绝迹,因此,唐鱼于1989年被列为国家Ⅱ级保护水生野生动物,随后被收录于中国濒危动物红皮书(鱼类)。
自2004年以来,在我国华南地区相继发现了多个唐鱼野生种群,其濒危状态和等级也于最近被重新评估,由野外灭绝降为极危[9]。近年来发现的唐鱼各个野生种群之间是否存在形态和遗传分化、是否具有种群结构、其种群结构呈现何种特征、野生种群与养殖群体之间的形态和遗传分化程度如何,这些是极具研究价值的重要科学问题。
三、涉及的知识和基本要求:
该课题要求学生应具备或需要掌握的基本知识、基本技能;有文献查阅、外文翻译、论文撰写等要求
3.1能熟练阅的读英文文献;
3.2准确查找相关文献;
3.3要求掌握基本的实验原理,实验步骤,实验流程以及实验应注意事项;
四、选题研究的方法与主要内容
4.1实验方法有传统形态学测量法和地标点法
传统形态学测量法所测量的形态特征是直观可见的,是指利用生物体一些肉眼可见的或仪器测量动物的形态学性状,包括可量化的以及不能量化的数据,如长度、高度、重量、颜色等,由于这些形态学性状是一些表型性状,易受到外界养殖环境等影响,因此容易用于比较不同地理群体的种群的形态差异。由于传统形态学测量直观,容易操作,结果的可信度也是较高的,因此国内水产渔业关于形态差异的研究多采用传统形态学方法来获得统计学比较的基础数据。
地标点类型 landmark type |
定义 definition |
Ⅰ型地标点 Type I landmark |
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背鳍起点origin of dorsal fin |
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背鳍基部末端posterior end of dorsal fin base |
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尾鳍基部上端upper insertion of caudal fin base |
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尾鳍基部下端lower insertion of caudal fin base |
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臀鳍起点origin of anal fin |
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臀鳍基部末端posterior end of anal fin base |
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腹鳍起点insertion of pelvic fin |
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胸鳍起点insertion of pectoral fin |
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鳃盖上缘the upper end of the operculum where it connects to the body |
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前腮盖骨腹侧起点insertion of the operculum on the lateral profile |
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尾鳍起点the starting point of the caudal fin |
Ⅱ型地标点 Type II landmark |
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吻端tip of snout |
Ⅲ型地标点 Type III landmark |
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眼前缘the anterior margin of the eye |
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眼后缘the posterior margin of the eye |
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鳃盖后缘Trailing edge of the operculum |
2.3.2平均形和相对扭曲主成分分析
四、论文工作进度安排
2018.3.9之前——查找相关文献数篇,学习相关试验方法,写出研究思路,完成开题报告。
3.9-3.31——继续查找相关文献数篇,翻译完英文文献1篇; 总结国内外有关几何形态测量学方法的研究进展;
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